Epidemiological and TNFα polymorphism evaluation in patients with cryptococcal meningitis treated at a referral hospital in North Brazil

Abstract INTRODUCTION: The present study evaluated the epidemiology of cryptococcal meningitis and TNFα gene polymorphisms in patients at a reference hospital in northern Brazil. METHODS: Samples from 25 patients infected with Cryptococcus spp. were collected to confirm the infection and to analyze the TNFα gene polymorphisms. RESULTS: Cryptococcus neoformans was detected as the predominant etiological agent (100%) in HIV-positive patients. No genetic polymorphic changes were found. CONCLUSIONS: No correlation was observed between the analyzed TNFα polymorphisms and cryptococcal meningitis.

Dideoxy single allele-specific PCR - DSASP new method to discrimination allelic

Gastric cancer (GC) is a multifactorial disease with a high mortality rate in Brazil and worldwide. This work aimed to evaluate single nucleotide polymorphisms (SNP) rs1695, in the Glutathione S-Transferase Pi (GSTP1) gene in GC samples by comparative analysis Specific PCR - ASP and Dideoxy Single Allele-Specific PCR - DSASP methods. The DSASP is the proposed new method for allelic discrimination. This work analyzed 60 GC samples, 26 diffuse and 34 intestinal types. The SNP rs1695 of the GSTP1 gene was significantly associated with GC analyzed by DSASP method (χ2 = 9.7, P < 0.05). A comparative analysis of the data obtained from both methods did not differ significantly (χ2 = 0.08, P > 0.05). These results suggest that the SNP rs1695 of the GSTP1 gene was a risk factor associated with gastric carcinogens is and the DSASP method was a new successfully low-cost strategy to study allelic discrimination.

Lack of evidence for human infection with Xenotropic murine leukemia virus-related virus in the Brazilian Amazon basin

Introduction This study confirmed the absence of natural infection with Xenotropic murine leukemia virus-related virus (XMRV) or XMRV-related disease in human populations of the Brazilian Amazon basin. We demonstrated that 803 individuals of both sexes, who were residents of Belem in the Brazilian State of Pará, were not infected with XMRV. Methods Individuals were divided into 4 subgroups: healthy individuals, individuals infected with human immunodeficiency virus, type 1 (HIV-1), individuals infected with human T-lymphotrophic virus, types 1 or 2 (HTLV-1/2), and individuals with prostate cancer. XMRV infection was investigated by nested PCR to detect the viral gag gene and by quantitative PCR to detect pol. Results There was no amplification of either gag or pol segments from XRMV in any of the samples examined. Conclusions This study supports the conclusions of the studies that eventually led to the retraction of the original study reporting the association between XMRV and human diseases. .

Human Papilloma Virus: Prevalence, distribution and predictive value to lymphatic metastasis in penile carcinoma

Objectives To evaluate the prevalence, distribution and association of HPV with histological pattern of worse prognosis of penile cancer, in order to evaluate its predictive value of inguinal metastasis, as well as evaluation of other previous reported prognostic factors. Material and Methods Tumor samples of 82 patients with penile carcinoma were tested in order to establish the prevalence and distribution of genotypic HPV using PCR. HPV status was correlated to histopathological factors and the presence of inguinal mestastasis. The influence of several histological characteristics was also correlated to inguinal disease-free survival. Results Follow-up varied from 1 to 71 months (median 22 months). HPV DNA was identified in 60.9% of sample, with higher prevalence of types 11 and 6 (64% and 32%, respectively). There was no significant correlation of the histological characteristics of worse prognosis of penile cancer with HPV status. Inguinal disease-free survival in 5 years did also not show HPV status influence (p = 0.45). The only independent pathologic factors of inguinal metastasis were: stage T ≥ T1b-T4 (p = 0.02), lymphovascular invasion (p = 0.04) and infiltrative invasion (p = 0.03). conclusions HPV status and distribution had shown no correlation with worse prognosis of histological aspects, or predictive value for lymphatic metastasis in penile carcinoma. .

Low frequency of human papillomavirus detection in prostate tissue from individuals from Northern Brazil

The presence of human papillomavirus (HPV) was evaluated in 65 samples of prostate tumours and six samples of prostates with benign prostatic hyperplasia from individuals from Northern Brazil. We used a highly sensitive test, the Linear Array HPV Genotyping Test, to detect 37 high and low-risk HPV types. In this study, only 3 percent of tumour samples showed HPV infection. Our findings support the conclusion that, despite the high incidence of HPV infection in the geographic regions studied, HPV was not associated with a higher risk of prostate cancer. To our knowledge, this is the first study evaluating the frequency of HPV detection in prostatic tissue of individuals from Brazil.

Study of Methylation Pattern of de Novo DNA Methyltransferase Genes and its Correlation with DNA Methylation Pattern of RUNX3 in Individuals with Gastric Cancer from Northern Region of Brazil / Estudio del Estado de Metilación de Novo de Genes Metiltransferasas y su Correlación con el Patrón de Metilación de RUNX3 en Individuos con Cáncer Gástrico de la Región Norte del Brasil

Gastric cancer is the forth malignancy in frequency in the world. In the northern Brazil is the second neoplasia most frequent in males and the third most frequent in females. Genetic and epigenetic alterations are evolved on gastric carcinogenesis and DNA methylation is the epigenetic alteration better studied. We analyzed de novo DNA methyltransferases methylation pattern and its association with RUNX3 gene methylation pattern in Brazilian samples of intestinal-type and diffuse-type of gastric cancer. PCR methylation specific was used to evaluate DNA methylation pattern. Sixty-six samples were studied in this work. Only the gene RUNX3 presented altered methylation pattern, being methylated in 38.5% of gastric cancer intestinal-type samples and in 70% of gastric cancer diffuse-type samples and, by this reason, it should be evolved in the genesis of this neoplasia. There was a statistically significant difference among diffuse-type and intestinal-type samples (p=0.0418) and among normal and tumour tissues (p<0.0001) for RUNX3 gene but not to DNMT3A, DNMT3B e DNMT3 genes on CpG islands analyzed. Alteration of RUNX3 methylation pattern is not associated to de novo alteration of DNA methyltransferases methylation pattern on studied regionsTherefore, it becomes necessary a better comprehension of this phenomenon on gastric carcinogenesis.

El cáncer gástrico es la cuarta patología más frecuente en el mundo. En el norte del Brasil, es la segunda neoplasia más frecuente en hombres y la tercera en mujeres. Alteraciones genéticas y epigenéticas relacionadas con la carcinogénesis gástrica y la metilación del DNA son las alteraciones epigenéticas mejor estudiadas. En este trabajo, analizamos el estado de novo de metilación de genes DNA metiltransferases y su asociación con el estado de metilación del gen RUNX3 en muestras de individuos brasileños con cáncer gástrico de los tipos intestinal y difuso. Fue usada la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR), metilación específica, para analizar el estado de metilación del DNA. Fueron estudiados 66 tejidos tumorales. Solamente el gen RUNX3 presentó un estado de metilación alterado, estuvo metilado en 38,5% de las muestras de cáncer gástrico tipo intestinal y en 70% de muestras de cáncer gástrico tipo difuso, lo que sugiere que estaría relacionado con la génesis de esta neoplasia. Hubo una diferencia estadística significativa entre muestras de los tipos difuso e intestinal (p=0.0418) y entre tejidos normal y tumoral (p<0.0001)parael gen RUNX3. Esta asociación no fue encontrada para los genes DNMT3A, DNMT3B y DNMT3 en las islas CpG analizadas. Alteraciones del estado de metilación de RUNX3 no están asociadas con alteraciones de novo de genes DNA metiltransferases. De esta forma se hace necesaria una mejor comprensión de este fenómeno en la carcinogénesis gástrica.

Chromosome instability in carcinomas / Inestabilidad Cromosómica en Carcinomas

Los modelos actuales de carcinogénesis consideran la ocurrencia de mutaciones crecientes y mecanismos selectivos, favoreciendo la sobrevivencia y proliferación celular aumentada. Mecanismos epigenéticos también participan en la oncogénesis, destacando la metilación del DNA. La característica de las células tumorales que permite el aumento de la ocurrencia de mutaciones es denominada inestabilidad genética, donde son identificados dos mecanismos: inestabilidad de microsatélites, caracterizada por alteraciones nucleotídicas con errores en los sistemas de reparación del DNA; inestabilidad cromosómica, en la cual las aberraciones suceden en grandes segmentos cromosómicos. Los carcinomas son caracterizados por alteraciones citogenéticas complejas y grandes mezclas génicas. Alteraciones teloméricas, quiebres de DNA reparados inadecuadamente y deficiencia en los sistemas de chequeo del huso mitótico, son eventos capaces de generar inestabilidad cromosómica y aneuploidía que caracterizan estas neoplasias más agresivas. El conocimiento de los mecanismos que provocan la inestabilidad cromosómica puede permitir la utilización clínica de información en el desarrollo de estrategias terapéuticas más adecuadas, dirigidas a puntos específicos involucrados en procesos de malignización.

In the current carcinogenesis models, the occurrence of increasing mutations and selection mechanisms favoring cell survival and higher proliferation rates are taken into account. Epigenetic mechanisms, among which DNA methylation stands out, also take part in oncogenesis. The characteristic of tumor cells that allows the increase of mutations is named genetic instability, encompassing two mechanisms: microsatellite instability, characterized by nucleotide alterations with errors in the DNA repair systems; and chromosomal instability, represented by aberrations occurring in large chromosome segments. Carcinomas are characterized by complex cytogenetic alterations and large gene amalgamations. Telomeric alterations, inadequately repaired DNA breaks, and deficiencies in the mitotic spindle checking systems are events capable of generating the chromosomal instability and aneuploidy which characterize more aggressive neoplasias. A better understanding of the chromosomal instability mechanisms can show the way towards a clinical utilization of such information, like developing more adequate therapeutic strategies, targeted at specific sites involved in the malignization process.

Drifter technique: a new method to obtain metaphases in Hep-2 cell line cultures

A linhagem celular Hep-2 é formada por células de carcinoma da laringe e é muito utilizada em modelos de carcinogênese e mutagenêse. Para avaliar o potencial proliferativo desta linhagem, desenvolvemos uma metodologia citogenética (técnica do sobrenadante) para obtenção de metáfases a partir de células que, ao entrarem em mitose, perdem adesão celular, ficando em suspensão no meio de cultura. Através deste procedimento, foram contadas 2000 células, correspondendo a um índice mitótico (IM) de 22.2% . Apesar de o IM obtido por esta técnica não ter sido estatisticamente diferente do IM obtido por outras metodologias citogenéticas clássicas, a técnica do sobrenadante é vantajosa porque elimina o uso de alguns reagentes utilizados na obtenção de metáfases e também diminui o consumo de reagentes de manutenção desta linhagem.

Cytogenetics in pediatric medulloblastomas

A meduloblastoma é um tipo de tumor frequentemente encontrada na infância e adolescência. É geralmente encontrada na fossa posterior (também conhecida como o compartilhamento infratentorial) e afeta, principalmente, o cerebelo. Embora um progresso significativo tenha sido alcançado no tratamento destes pacientes, muitos aspectos do comportamento biológico deste tumor ainda estão incertos. Portanto o estudo dos eventos genéticos envolvidos nestas neoplasias poderia ser considerado uma ferramenta útil na compreensão destes tumores, desde que, o comportamento biológico de um tumor passou a ser determinado pelas suas alterações genéticas. Em meduloblastoma, a alteração observada com maior frequência é um isocromossomo 17, mas sozinha esta aberração não constitui um fator prognóstico; apenas reflete uma proliferação celular desenfreada. Vários genes (por exemplo, TP53, ABR e HIC-1) parecem estar relacionados à gênese destes tumores, mas estudos mais aprofundados são necessários para esclarecer o assunto. Os avanços no campo de citogenética molecular tem permitido a gênese de processos de proliferação. Portanto, o objetivo desta revisão é apresentar uma revisão atualizada da literatura sobre meduloblastoma.

Review article: chromosomal diagnosis in rhabdomyosarcoma

Os rabdomiossarcomas (RMS) são considerados tumores clinicamente agressivos com origem a partir de células mesenquimais imaturas e que se caracterizam pela presença de células com diferenciação pouco definida. O emprego das técnicas citogenéticas convencionais em RMS vem contribuindo consideravelmente para a diferenciação entre os rabdomiossarcomas alveolares e os outros tumores de células pequenas e redondas, além de fornecer informações prognósticas importantes referente ao rabdomiossarcoma do tipo alveolar. Assim, este trabalho visa a realizar uma revisão das alterações citogenéticas observadas nos diferentes subtipos histológicos de RMS, enfocando não só os trabalhos de citogenética convencional, mas também novas abordagens utilizadas para o estudo de neoplasias tais como FISH, CGH, SKY e M-FISH. Tais metodologias vêm contribuindo de maneira significativa para a melhor compreensão da heterogeneidade cariotípica observada nos RMS.

Asociacion entre la pérdida del cromosoma x en mujeres de edad avanzada y el polimorfismo de la apolipoproteina a-iv: 360 gln/his / Association of chromosome x loss in elderly women with apolipoprotein a-iv: 360 polymorphism

La pérdida del cromosoma X en mujeres, asociada a la edad avanzada, es un fenómeno ya reconocido hace décadas. Los factores genéticos que llevan a esta pérdida o a la no-disyunción cromosómica, son poco conocidos. Polimorfismos de apolipoproteinas fueron asociados a la ocurrencia de sindromes cromosómicos como las trisomias del 18 y 21 y fue sugerida su participación en la segregación cromosómica. Polimorfismos de la apolipoproteina AIV:360 fueron asociados a molestias cardiovasculares en la población brasile¤a. Veinticuatro mujeres entre 72 a 87 a¤os, fueron seleccionadas para estudiar la presencia o ausencia del alelo 2 (HIS) y analizar la pérdida del cromosoma X. El analisis citogenético fue realizado en núcleos interfásicos de cultivos de linfocitos por técnica de hibridación in situ con sonda fluorescente centromérica del cromosoma X. El análisis genotipico fue realizado a partir de ADN extraido de la sangre, amplificado por PCR y digerido por la enzima de restricción Fnu4HI. Se observó una proporción significantemente mayor de células con la perdida del cromosoma X, en mujeres con alelo 2 (HIS). Estos resultados indican la participación del gen de la ApoA-IV en la no-disyunción cromosómica. Los mecanismos de su actuación pueden estar relacionados a da¤os oxidativos producto de alteraciones en la microcirculación e inducción de muerte celular. La comprensión de este mecanismo todavia necesita de mayor investigación.

Mutagenicity of hydroxyurea in lymphocytes from patients with sickle cell disease

Hydroxyurea is commonly used in the treatment of myeloproliferative diseases and in patients with sickle cell disease (SCD). The use of this antineoplastic agent in patients with SCD is justified because of the drug's ability to increase fetal hemoglobin levels, thereby decreasing the severity of SCD. However, high doses or prolonged treatment with hydroxyurea can be cytotoxic or genotoxic for these patients, with an increased risk of developing acute leukemia. This danger can be avoided by monitoring the lymphocytes of patients treated with hydroxyurea. Cytogenetic tests are important endpoints for monitoring the physiological effects of physical and chemical agents, including drugs. In this work, we assessed the genotoxicity of hydroxyurea in short-term cultures of lymphocytes from SCD patients. Hydroxyurea was not cytotoxic or genotoxic at the concentrations tested in the G2 phase of the cell cycle. These results support the use of hydroxyurea in the treatment of SCD, although further work is necessary to understand the effects of this drug in vivo.

Interleucina 1Beta (IL-1Beta) na gênese do câncer gástrico / Iinterleukin 1Beta (IL-1Beta) in the development for gastric cancer

Introdução:Dentre os tumores diagnosticados em todo o mundo, o adenocarcinoma gástrico é o segundo tipo de câncer mais freqüente e representa uma das principais causas de mortalidade por câncer. O Estado do Pará apresenta elevada prevalência desta neoplasia assumindo características de saúde pública. A interleucina 1 beta (IL-1beta) modula várias funções das células gástricas parientais e desta forma, alguns estudos demonstraram que a IL-1beta age como um poderoso inibidor da secreção gástrica, com um efeito anti-secretório secundário à infecção pelo Helicobacter pylori contribuindo para hipoacidez do estômago. A ocorrência de diferentes polimorfismos no conjunto de genes da IL-1beta, estão sendo associados com o aumento da produção da mesma e elevado risco para o desenvolvimento de hipocloridria e câncer gástrico. Os diferentes alelos da IL-1beta descritos diferenciam-se por transição da base citocina para timina nas posições -511, -31 e +3954 pares de bases do sítio de início transcricional, enquanto que os diferentes alelos do receptor antagonista da L1beta(IL-NR) possuem números variáveis de uma seqüência de 87 bases localizadas no segundo intron desse gene os quais onduzem a um aumento da produção da interleucina tais como seus precursores.Objetivo:Discutir a correlação do envolvimento dos diferentes polimorfismos da IL1beta nas doenças gástricas. Método:Realizada revisão da literatura utilizando os trabalhos recentes sobre o assunto. Considerações finais:É demonstrada a importância do envolvimento dos polimorfismos da IL1-beta nas doenças do estômago, como biomarcadores que possam ser utilizados como fatores prognósticos do desenvolvimento de câncer gástrico

Genes e câncer: revisão / Genes and cancer: a revieww

Introdução: Nos dias atuais o câncer ocupa uma posição de destaque, contribuindo de maneira significativa para o alto índice de mortalidade na população mundial, chegando a assumir características de problema de saúde pública. Para tentar compreender o processo carcinogênico, e planejar formas racionais de tratamento, é necessário entender a biologia da célula e suas interações nos tecidos principalmente no que tange aos eventos genéticos envolvidos. Objetivo: Discutir os elementos ( oncogenes, genes supressores de tumor, genes de reparo e fatores de crescimento) e mecanismos genéticos que atuam na gênese do câncer: Método: Realizada revisão bibliográfica utilizando os mais recentes trabalho a respeito do assunto. Considerações Finais: O melhor entendimento do processo carcinogênico fornecerá um maior embasamento para a descoberta de novos tratamentos na prevenção ou cura do câncer

Efeitos biológicos do mercúrio e seus derivados em seres humanos: uma revisão bibliográfica / Biological effects of mercury and its compounds in human being: a mini-review

Introdução: O mercúrio e seus derivados são considerados poluentes ambientais originados de várias fontes. A preocupação maior a respeito da poluição mercurial é decorrente dos efeitos à saúde relacionados à exposição ao mercúrio metilado (metilmercúrio) encontrado na água e alimentos aquáticos. O sistema nervoso central é o alvo principal do metilmercúrio. Este metal também é reconhecidamente um agente teratogênico. No entanto, seus efeitos genotóxicos(ação no DNA) são de difícil interpretação e contraditórios. Objetivo: Este trabalho tem por objetivo realizar uma revisão bibliográfica enfocando os efeitos biológicos deste metal e seus derivados em humanos, visando uma melhor compreensão sobre seu variado modo de ação na saúde dos indivíduos. Método: Foi realizado um levantamento bibliográfico com trabalhos pertinentes, enfatizando-se a produção mais recente a respeito do assunto. Considerações Finais: Os efeitos biológicos do mercúrio e seus derivados são extremamentes variados, apresentado, no entanto, consequências suficientemente graves que justificam a realização cada vez maior de estudos suplementares, que servirão como modelos para manter a integridade da saúde de pessoas expostas

Investigation of single strand conformational alterations of the TP53 gene in epithelial hyperplasias of the breast

Generally, benign breast lesions behave as innocuous and limited proliferations, but sometimes they can represent pre-cancerous diseases. The practical importance of epithelial hyperplasias studies is related to their potential for malignant transformation. The TP53 tumor supressor gene suffers the greatest number of mutations in human cancer Using single strand conformational polymorphism, we did a mutation screening in exons 5 to 8 of the TP53 gene in the tumoral tissues of five patients with epithelial hyperplasias of the breast. The obtained results do not show any polymorphism that indicates mutation. The lack of mutation indicates that this gene is not involved in the initial process of malignization, strengthening the hypothesis that mutations on TP53 gene are a late event in the breast carcinogenesis.

Karyotypic and histopathologic findings in an accessory breast

Accessory breasts are a clearly hereditary anomaly. They enlarge during pregnancy and lactation as a consequence of high blood levels of estrogen and prolactin, and are subject to all the diseases that occur in normal breasts. Cytogenetic analysis was performed on one accessory breast. The monossomy of chromosome 16 was the main alteration found in this materal. Nonscheduled cell proliferations may produce chromosome alterations, most of them with no clinical meaning. When relevant genes are altered, major proliferations or progression to malignancy may occur.

Genotoxic effects of mercury on in vitro cultures of human cells

Mercury is a highly deleterious environmental pollutant, with recognized mutagenic and teratogenic efects. Given this, we evaluated the changes induced in vitro by two mercury compounds (mercury chloride - MC - and methyl mercuric chloride - MMC) on the genetic) material of a human lymphoblastoid cell line (TK6) on the basis of both the frequency of mutations at the hprt locus, and the number of chromosomic anomalies. The frequencies of HPRT mutants in the TK6 cell line following exposure to the mercury compounds are inconclusive with regard to a mutagenic effect. However, both mercury compounds exhibit a clear cytotoxic effect, which increases with dosage. There was also no statiscally significant increase in the frequency of chromosomic bleakage or gaps, nor in the number of cells with chromosomic alterations in the lymphoblastoid line. Nevertheless, MMC did provoke a marked reduction in the frequency of mitosis, both on its own and in combination with MC.